Protac（蛋白質降解靶向嵌合分子）的鑒定是一個關鍵的步驟，用于確認其對目標蛋白質的選擇性和有效性。以下是一些常用的Protac鑒定方法：

細胞系實驗：通過在細胞系中表達目標蛋白質和評估Protac對其降解的影響來驗證Protac的活性。這可以通過Western blot或其他蛋白質檢測方法來檢測目標蛋白質的水平變化來實現。

熒光標記：將Protac或目標蛋白質標記為熒光標記物，以便跟蹤它們在細胞內的位置和相互作用。

蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）實驗：使用技術如蛋白質共沉淀或雙向免疫沉淀來驗證Protac是否能夠促使目標蛋白質與E3連接酶結合。

蛋白質穩定性分析：通過測量目標蛋白質的半衰期來評估Protac對其穩定性的影響，因為降解的蛋白質通常具有較短的半衰期。

轉錄水平分析：通過實時熒光定量PCR（qPCR）等技術檢測目標蛋白質的mRNA水平，以確定Protac是否影響其轉錄。

蛋白質合成抑制實驗：通過添加蛋白質合成抑制劑（如環丙沙星）來驗證Protac引起的蛋白質降解是否依賴于新蛋白質合成。

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