動物組織基因組提取試劑盒
本試劑盒采用具有獨特分離作用的磁珠和緩沖液系統(tǒng),從樣品中分離純化**基因組DNA,特殊包被的磁珠,在一定條件下對目的DNA具有很強(qiáng)的親和力,而當(dāng)條件改變時,磁珠釋放吸附的DNA,能夠達(dá)到快速分離純化DNA的目的。整個過程不涉及有毒試劑,安全、便捷、提取的DNA純度高。使用本試劑盒純化的基因組DNA均在1.7~2.0之間,可以應(yīng)用到各類下游分子生物學(xué)實驗。
適用范圍
從動物組織中提取基因組DNA,適用于核酸自動化提取平臺。
試劑盒包裝及組成
試劑盒組成 | 數(shù)量 |
裂解液S1 | 50ml*1 |
裂解液S2 | 20ml*1 |
結(jié)合液 | 50ml*1 |
磁珠 | 1.5ml*2 |
洗脫液 | 20ml*1 |
使用說明書 | 1份 |
圖譜:
注意事項
1、磁珠使用前一定要充分混勻。
2、如果下游實驗對RNA污染比較敏感,可在裂解時加1μl RNaseA(10mg/ml)。
3、如果是干材料,適當(dāng)延長裂解時間;種子用粉碎機(jī)打成粉末狀使用,樣品為種子時,裂解時間為30min。
4、如果同等取樣量下欲得到更多DNA可以增加洗脫次數(shù)(洗脫次數(shù)**不要超過3次),也可以適當(dāng)延長裂解時間。
5、取材量參照下面表格
材料 取樣量
動物肌肉組織 <50mg
脂肪 <50mg
脾臟 <20mg
肝臟 <20mg
胰臟 <20mg
操作步驟
1、裂解
取新鮮動物組織10mg~50mg,與研缽中研磨。加入480μl裂解液S1、120μl裂解液S2、20μl蛋白酶K,研磨均勻,然后轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管中,吹打或點陣混合均勻。然后把EP管置于恒溫水箱中65℃溫育15~30min。
2.結(jié)合
將EP管從溫育設(shè)備中取出,12000rpm離心10min。取500μl上清,加入振蕩混勻的磁珠30μl、500μl結(jié)合液(也可加入500μl異丙醇,產(chǎn)量高于加結(jié)合液,但A260/A280略有降低,不影響下游實驗),顛倒混勻2min,時文靜置1min。將EP管置于磁力架上進(jìn)行磁分離,吸棄廢液(注意吸凈管蓋及管底殘液)。
3.洗滌
⑴加入600μl 70%乙醇,吸打或點振5~10次,然后磁分離,注意吸凈管蓋及管底的殘液;
⑵重復(fù)步驟⑴一次,室溫下開蓋干燥10-20min或恒溫箱(不高于55℃)內(nèi)開蓋干燥5min,注意防止污染。
4.洗脫
加入100μl洗脫液,緩慢抽吸混勻,65℃溫浴10min。每隔2~3min輕搖EP管幾下混勻。然后磁分離,小心吸取上清液至新的EP管中,即可進(jìn)行下游實驗。
常見問題及參考意見
得率低
(1)樣品沒有研磨充分,請盡量將樣品研磨充分;
(2)組織沒有完全裂解完,裂解時間不夠或沒有離心直接進(jìn)行下一步操作;
可適當(dāng)延長裂解時間,**不超過60min。樣品裂解后,請一定要離心后再進(jìn)行下一步操作;
(3)結(jié)合不充分;
結(jié)合過程中要使磁珠一直處于懸浮狀態(tài),并且充分顛倒混勻;
(4)取樣量大于說明書給出量;
取樣量請嚴(yán)格按照說明書操作。
條帶彌散
(1)樣品不新鮮或反復(fù)凍融多次:盡量用新鮮樣品進(jìn)行試驗,如果樣品需要保存,可根據(jù)試驗,分裝保存樣品,盡量避免反復(fù)凍融;
(2)研磨時間太長,造成核酸降解:請研磨盡量迅速,防止DNA降解;
(3)環(huán)境溫度太高:可以將研缽置于-20℃預(yù)冷或置于液氮保存后再進(jìn)行研磨,如果所提取材料基因組極易降解,可用液氮研磨;
(4)裂解時間太長:裂解時間不要超過60min;
(5)提取后模板DNA放置時間太長:提取后如有需要,請盡量及時進(jìn)行電泳試驗。短期內(nèi)可置于4℃保存,長期請置于-20℃保存(盡量注意避免反復(fù)凍融)。
DNA液有顏色
(1)洗滌過程不充分:如果結(jié)合后磁珠呈團(tuán)狀、絲狀或顆粒狀,要增加點震力度及次數(shù),充分吹打混勻。
(2)裂解不充分:將組織充分研磨、適當(dāng)增加裂解液S1和S2用量,也可以延長裂解時間。
(3)樣品用量大于說明書給出量而其他試劑用量沒有相應(yīng)調(diào)整:嚴(yán)格按照說明書操作,如果需要增大樣本量,可以等比例增大裂解液S1、S2、蛋白酶K以及磁珠用量,其他試劑用量可不改變。
DNA樣品不純,干擾后續(xù)實驗
(1)DNA液有乙醇?xì)埩簦合礈鞎r,請注意吸凈管蓋及管底的殘液。此外,磁珠應(yīng)完全干燥,保證無乙醇?xì)埩簟?/p>
(2)磁珠洗滌不充分:加入70%乙醇時,請吸打或點振混勻。如有必要,可增加一次洗滌步驟。
(3)DNA液中吸入磁珠:如果不小心吸入磁珠,請將上清液返回原管,待磁珠完全吸附至管壁后重新吸取上清。或者將吸取的上清液10,000rpm離心2min,再取上清。
(4)DNA液中含有蛋白質(zhì)等雜質(zhì):建議適當(dāng)減少樣品用量。
(5)DNA液中含有輕微鹽離子等雜質(zhì),此為TE保存液正常現(xiàn)象,不影響下游實驗。如有特殊需要,可使用等量的經(jīng)高壓滅菌的去離子水作為洗脫液。為方便實驗,可將獲得的DNA液置于-20℃環(huán)境分裝保存。
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