分析13C或15N標記的中心碳代謝及相關途徑的極性代謝物
提出了一種基于靶向串聯質譜分析(LC-MS / MS)的方法,用于分析極性代謝物的13C或15N標記情況。該平臺利用三重四極桿(QQQ)質譜儀,極性切換的選擇性反應監測模式(SRM)和酰胺親水作用液相色譜(HILIC),捕獲碳和氮在選定代謝物中的離子對。本方案是對先前發表的非標記靶向代謝組學方案的擴展,并已廣泛用于追蹤各種生物樣本(例如,體外細胞培養實驗和經靜脈注射小鼠體內標記)中營養物質的代謝,如13C標記的葡萄糖,13C-谷氨酰胺和15N-谷氨酰胺等。
對SRM信號進行積分,生成每種標記形式的峰面積陣列。將處理后的數據用于獲得目標分子標記的程度和分布(稱為代謝流量組學)。每種方法都可以基于已知的未標記Q1 / Q3 SRM離子對而定制,并根據相應的13C或15N標記情況進行調整。從標記實驗、代謝物提取到峰積分,單個樣品的整個過程大約需要6-7小時。
實驗步驟
1 提取代謝物并添加同位素標記。代謝物可以從多種不同的生物來源樣本中提取,根據樣本類型和實驗目的選擇相應的提取方法,然后考察確定標記時間。
2 設置MS方法。根據正負離子檢測模式調整Q1 / Q3 SRM離子對列表,匹配每種代謝物的13C或15N標記類型。
3 將樣品重懸于約20-25 μL LC-MS級水中,然后通過自動進樣器進樣5 μL,使用步驟2中Analyst軟件中定義的靶向采集方法。
4 使用分析和峰積分軟件(例如SCIEX的MultiQuant),在質譜圖中查找13C/15N標記峰以及未標記的12C峰。
5 作為SRM的替代方法:可以進行高分辨率LC-MS / MS分析,高分辨質譜儀應在MS和MS / MS模式下均具有**精度且有極性切換功能,例如QExactive Orbitrap的數據相關采集(DDA)模式。
結果
此平臺可用于分析未標記(12C或14N)和標記(13C或15N)的代謝物。應根據生物學問題選擇靶向SRM LC-MS/MS方法,提供了超過140個全標記代謝物的分析方法和多達40-50個獨特代謝物的同位素分析。圖1 是靶向13C代謝組學工作流程,展示了從代謝物提取、LC-MS / MS采集到數據統計分析的整套流程。
產品供應:
3C同位素標記的松柏醇葡萄糖甙 | 碳-13同位素標記的溴化膦化合物 |
(11C、13C、14C、D、3H、18O)同位素標記葡萄糖 | 碳同位素標記雙酚S和雙酚AF |
13C同位素標記木素木素-木聚糖復合體13C-NMRHSQC | 同位素標記磷酸三苯酯化合物 |
14C標記葡萄六糖 | 同位素標記鏈狀化合物 |
(13)C標記尿苷二磷酸葡萄糖 | 同位素標記環狀化合物 |
同位素標記寡糖和多糖 | 同位素標記碳氫化合物 |
13C穩定性同位素標記1,6縮水β-D-吡喃葡萄糖 | 同位素標記烴的衍生物 |
同位素標記仿生糖/糖組 | L-亮氨酸-U-13C6 |
N-糖鏈雙同位素標記 | 13C標記L-亮氨酸示蹤劑 |
同位素標記1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸 | 穩定同位素標記多肽氨基酸 |
同位素標記2-甲基-D-赤蘚糖醇-4-磷酸 | 穩定同位素馬來酸酐標記 |
葡萄糖-D-13C6 | 穩定同位素13C標記的sp2碳納米材料 |
穩定同位素標記吉西他濱-13C/15n2 | 穩定性同位素13C標記富勒烯C60 |
雙標記尿嘧啶核苷-(13C,15N2) | 同位素13C標記的4-羥基脯氨酸 |
13)C-海藻糖 | 同位素13C標記二氯乙酸 |
13C穩定性同位素標記纖維素 | 穩定同位素(13)C標記乙醇 |
15N穩定性同位素標記L-谷氨酸 | 同位素標記莨菪亭-2-13C |
(125)I標記胰高糖素 | 同位素13C,15N雙標記-氨基脲鹽酸鹽 |
穩定同位素巰基化合物標記 | C-13同位素標記17β-雌二醇([3,4-13C]-17β-E2) |
(13)C標記氨基酸化合物 | 13C-全標記乙酸鈉 |
同位素標記哌蟲啶 | 13C-標記17芳香雌二醇([3,4-13C]-17β-E2) |
同位素標記環氧蟲啶 | 同位素13C標記水楊酸 |
同位素標記順硝烯新煙堿類化合物 | 同位素^13C標記小麥植株 |
吖啶酮類穩定同位素巰基化合物標記 | 同位素13C/D標記對甲氧基苯甲酸 |
穩定同位素標記N?(4?(吖啶酮?10?基)?苯基)?N | D-13C6-甘露糖 |
同位素標記馬來酰亞胺基團 | 13C同位素標記硫酸鹽木素 |
穩定同位素標記莨菪亭213C | 13C同位素標記果膠-木素復合物 |
穩定同位素13C標記C60 | 13C同位素標記木質素與木聚糖復合物 |
穩定同位素標記脫氧核苷代碼 | (13)C標記甘氨膽酸 |
穩定同位素標記脫DNA N6-甲基腺嘌呤 | 同位素(13)C標記富勒醇納米顆粒 |
穩定同位素15N標記化合物 | 13C和15N穩定同位素雙標記 |
同位素標記有機金屬釕化合物 | 同位素標記合成吉西他濱-13C |
同位素標記蛋白酪氨酸磷酸酶1B | 苯甲酸-13C同位素標記 |
丙酯草醚和苦皮藤素同位素標記物 | 雙標記13C,15N3-呋喃妥因 |
穩定同位素標記堿性橙Ⅱ | N,N-二異丙基-[(1-13C)乙基]胺化合物 |
穩定同位素標記苯 | α-13C標記β-O-4型木素模型化合物 |
穩定同位素標記硝基苯 | 愈創木基丙三醇-β-愈創木基醚-[α-13C] |
氘代有機化合物 | 13C,14C同位素標記17-E2,17-E2,E1 |
氘標記化合物 | 13C,14C同位素標記雌酮(E1) |
同位素標記氨基甲酸酯(3a-3c) | 13C,14C同位素標記17β-雌二醇(17-E2) |
藍藻碳穩定同位素標記 | 13C,14C同位素標記17-雌二醇(17β-E2) |
穩定同位素標記氮素 | 13C,14C同位素標記天然固醇類雌激素 |
穩定同位素MALDI-TOF-MS | 穩定性同位素碳13全標記L型亮氨酸 |
植物碳同位素標記 | 同位素標記原兒茶酸-(13COOH) |
穩定同位素標記鹵代苯-Dsub5/sub | 13C標記脂肪酸的同位素 |
穩定同位素標記13C6結晶紫 | 3C穩定性同位素標記1,6-縮水-β-D-吡喃葡萄糖 |
穩定同位素標記13C6隱色結晶紫 | 13C內醚糖/13C葡萄糖 |
穩定同位素標記15N-N,N-二甲基苯胺 | 13C標記磷脂脂肪酸 |
穩定同位素氘標記D6-結晶紫 | DNA-穩定同位素探針標記 |
穩定同位素標記溴布特羅-D9 | 同位素標記物D3-左氧氟沙星 |
穩定同位素標記鹵代苯-D5 | 穩定同位素標記雙酚F-D8 |
穩定同位素標記D4-羅丹明B | 氘代沃拉帕沙 |
穩定同位素標記氨基甲酸乙酯-D5 | 穩定同位素標記磷脂 |
穩定同位素標記堿性嫩黃O-D12 | 穩定同位素標記氯丙那林-D6 |
同位素標記氨基甲酸乙酯-D5 | 同位素標記常咯啉 |
穩定同位素標記敵百蟲 | 穩定同位素標記D5-氯氰菊酯 |
穩定同位素標記甲氧基一D/甲氧基姻6 | 穩定同位素D標記甜蜜素 |
穩定同位素標記鹵代苯 | 同位素氘標記2-甲基-4-異噻唑-3-酮 |
同位素標記D6-苯 | 同位素標記鄰苯二甲酸 |
穩定同位素標記堿性嫩黃O-D(12) | 氘標記苯乙醇胺類β受體激動劑 |
穩定同位素標記硼氘化鈉 | 氘代乙琥胺d5 |
穩定同位素標記妥布特羅-D9 | 氘標記川芎嗪 |
穩定同位素標記D6-二甲基黃 | 氘代維生素D類似物 |
穩定同位素標記孔雀石綠-D12 | 同位素氘代標記吡羅昔康-d3 |
穩定同位素標記2-異丙基硫雜蒽酮-D3 | 苯基羥乙酸酯氘標記化合物 |
穩定同位素標記雙氰胺 | 同位素標記的西布特羅-D9/馬布特羅-D9 |
同位素標記2異丙基硫雜蒽酮 | 氘標記夫沙那韋鈣鹽 |
穩定同位素氘標記亞磷酸二甲酯或亞磷酸三甲酯 | 同位素標記全氘代鄰二甲苯 |
穩定同位素氘標記有機磷殺蟲劑 | 同位素標記15N-N,N-二甲基苯胺 |
穩定同位素標記三苯甲烷類化合物 | 同位素標記3,5-二硝基水楊酸肼-15N2 |
穩定同位素標記克倫普羅化合物 | 15N同位素標記尿素 |
同位素標記2,6二氯苯胺 | 15N同位素標記L-精氨酸 |
同位素標記3,5二氯4氨基苯乙酮; | 同位素標記滅蠅胺-氨基-15N2 |
同位素標記3,5二氯4氨基苯乙酮 | 15N穩定同位素標記集胞藻 |
穩定同位素標記3,5二氯4氨基α溴代苯乙酮 | 蛋白質酰胺側鏈15N同位素標記 |
穩定同位素標記1(4氨基3,5二氯)2異丙基氨基乙酮 | 同位素標記15N-L-谷氨酰胺 |
同位素標記1(4氨基3,5二氯)2異丙基氨基乙酮 | 15N標記-L-賴氨酸鹽酸鹽 |
穩定同位素氘標記DDT | 同位素標記15N-L-天冬氨酸 |
同位素標記雙酚A或雙酚F衍生物 | 同位素標記15N-L-蛋氨酸 |
13C3-三聚氰酸 | 同位素15N標記水合肼 |
15N3-三聚氰胺 | 同位素15N標記2-甲基-5-硝基咪唑 |
穩定同位素標記脂肪酸 | 同位素15N標記L-天冬酰胺 |
同位素標記蛋白質 | 同位素15N標記L-半胱氨酸 |
同位素標記血紅素/葉綠素 | 同位素標記(15)N-N,N-二甲基苯胺 |
同位素標記酶/激素 | 同位素15N標記螺旋藻 |
同位素標記木醇/甲醇 | 同位素15N標記八肽擬生長因子 |
同位素標記酒精(乙醇) | 同位素15NN標記L-纈氨酸 |
同位素標記甘醇(乙二醇) | 1-18O穩定性同位素標記葡萄糖 |
同位素標記甘油(丙三醇) | 18O穩定同位素標記磷酸化蛋白質 |
同位素標記石炭酸(苯酚) | 15N標記鄰位芳香羥肟配位體 |
同位素標記蟻酸(甲酸) | 同位素15N標記三肽 |
同位素標記水楊醛(鄰羥基苯甲醛) | 15N穩定同位素標記副溶血弧菌 |
同位素標記肉桂醛(β-苯基丙烯醛) | 同位素15N標記氧化亞氮 |
同位素標記巴豆醛(2-丁烯醛) | 16O/18O標記糖肽 |
同位素標記氯仿(三氯甲烷) | 糖苷內切酶催化同位素標記n-糖鏈 |
上述產品僅用于科研,不可用于人體實驗!
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